Симптомы заболевания весьма изменчивы и широко распространены, но основной из них — постоянная усталость, как физическая, так и эмоциональная. Спортивные упражнения могут только усугубить ситуацию, чувство утомленности вернется через несколько часов или на следующий день после тренировки. Людям, страдающим от тяжелой формы СХУ, нелегко выполнять даже обычные повседневные дела — например мыться и одеваться. Кроме того, иногда наблюдаются мышечные, суставные, головные боли, плохая кратковременная память и низкая концентрация, боли в желудке, синдром раздраженного кишечника (СРК), боль в горле, плохой сон, психологические проблемы вроде депрессии, раздражительности и приступов паники, болезненность лимфатических узлов и чувствительность к свету, громким звукам, алкоголю и некоторым продуктам питания или их полная непереносимость