Еще одна проблема, вызванная «дырявым кишечником», – восприимчивость к продуктам питания. Частично переваренная пища, проходящая сквозь стенку кишечника, воспринимается иммунной системой как опасный захватчик. Часто эта пища помечается антителами, чтобы в следующий раз иммунной системе было проще реагировать при ее появлении. В итоге воспалительная реакция возникает всякий раз при ее употреблении.