Первые микробы, попадающие в кишечник новорожденного, чаще всего оказываются микробами из родового канала матери, и вследствие этого весомая доля их приходится на лактобактерии. Эти первые поселенцы относятся к типу факультативных анаэробов, то есть могут расти как в присутствии кислорода, так и без него. Они используют весь кислород в кишечнике малыша, тем самым подготавливая идеальные условия для того, чтобы позже там поселились облигатные анаэробы, то есть бактерии, живущие исключительно в бескислородных условиях