Свое название этот район Москвы получил от села Головино, имя которого неразрывно связано с родом Ховриных-Головиных. Внуком Григория Ховры был Иван Владимирович Голова, ставший родоначальником фамилии Головиных.
В Смутное время начала XVII в. Головино превратилось в пустошь, которая в 1614 г. была в поместье «за Гаврилом Васильевым сыном Хлоповым». В 1635 г. Гаврила Васильевич покупает часть земли, приписанной к Головину из поместья себе в вотчину, а через два года выкупает и все поместье. В 1683 г. Головино отмечается как деревня, а в писцовой книге 1686 г. пишется сельцом. Небольшое, в несколько дворов, сельцо делится многократно среди Хлоповых, пока один из них, Иван Иванович, не продает доставшуюся ему часть в 1737 г. советнику Семену Молчанову.