Еще одним показательным моментом истории Герды Вегенер было и то, что продолжением ее творчества стала скандальная личная жизнь: первый муж Герды, художник Эйнар Вегенер, оказался трансвеститом, о чем прекрасно знали в тогдашних европейских художественных кругах. Он любил появляться в обществе одетый в женские платья и представлялся сестрой своей жены Лили Эльбе. В конце концов, Эйнар решился на первую в истории операцию по смене пола, которую и провели ему в Германии в 1930 году.