Кишечник весь пронизан нервами, связанными со сплетениями вегетативной нервной системы. Стенки кишечника могут вбирать в себя воду, а могут отдавать ее в просвет кишки, таким образом формируются диарея или запоры. Перистальтика кишечника может быть более или менее активной. Все эти процессы тоже регулируются вегетативной нервной системой.