Его часто спрашивали о причинах той или другой болезни. Работая над решением этих вопросов, он пришел к убеждению, что отдельных болезней не существует, что заниматься происхождением отдельной болезни, как и лечить отдельный орган, – пустая трата времени, поскольку организм – это единое целое. Рассматривать болезни отдельно, к чему склонна современная медицина, по мнению К. Ниши, абсурдно. Болезнь нельзя объяснить ее происхождением, не учитывая конкретный человеческий организм, такой уникальный, «такой непостижимо совершенный и хрупкий одновременно».