Возьмем, например, такие обороты, как на самом деле, наконец, таким образом. За ними нужно следить очень внимательно, иначе можно попасть в ловушку!
Слово наконец, например, может быть и вводным, и не вводным.
Вводное: Во-первых, рифмы смешные, во-вторых, они помогают запомнить правила, наконец, они вдохновляют нас придумывать свои правила в стихах.
Не вводное: Наконец-то (когда?) я поставил запятую на место!
В первом случае слово наконец нужно, чтобы показать логику, ход мыслей. А во втором – оно просто выполняет роль обстоятельства времени.
Точно так же можно определить, нужно ли выделять запятыми сочетание таким образом. Если оно нужно, чтобы показать ход мыслей («Таким образом, мы пришли к выводу…», то без запятой не обойтись. А если оно отвечает на вопрос как? («Я год собирал новые слова и таким образом составил словарь»), то никаких знаков не потребуется.